首届舟马采用“鱼”的形象作为奖牌主体，而本届舟马的完赛奖牌继续沿用2015年海洋生物的概念，突破性地采用海螺作为奖牌的主体。奖牌设计糅合
舟山发达的海洋渔业文化，并以极具亲和力兼具设计感的圆弧形线条，对原本坚硬的海螺形象进行了艺术性加工。
奖牌以金铜色作为主色，勾勒出海螺的形状，加之浪花纹路的镂空，代表着宽广无垠的海洋；其上的蓝色部分，象征着被大海拥入怀中的
舟山群岛。奖牌正面突出“自在
舟山智慧跑”的主题，背面印有赛事名称、比赛时间和完赛里程等信息。奖牌带部分采用海蓝色，印有2016
舟山群岛马拉松的字样和LOGO，醒目的同时不失美观。
对于跑马者来说，完赛奖牌自然是对他们最好的肯定。本届舟马奖牌样式新颖优美，设计独具匠心，兼具收藏价值与观赏价值，让人们对这场
舟山马拉松充满了期待。
